北京市第一五九中学原名北京市第三女子中学，是一所具有近九十年历史，享有盛誉的完全中学。创始人是著名教育家熊希龄先生、陶行知先生和幼儿教育家张雪门先生。学校的办学理念是：追求卓越，师生共同发展。培养有风度、有品位、有修养的教师和学生。2020年4月26日，学校被认定为北京市第二批义务教育学校管理标准达标学校。
学校有一支高素质的教师队伍，他们爱岗敬业，业务精良。有以特级教师余兰老师为代表的8名西城区学科带头人;11名校级学科带头人;同时有68人取得了硕士或硕士研究生课程班的证书;还有12人正在读研究生课程。读研率占教师和管理人员的67%。学校现代化信息技术教育蓬勃开展，被评为市级电化教育优类校，98年西城区在该校召开了“计算机软件开发和利用”的现场会。
该校以课程改革为核心，重视师魂的铸造，加强青年教师的培养，全面推进素质教育。学校发扬“正己、敬业、爱生”教风，从学习型教师起步、向科研型教师迈进，已被全校教职工所认同，并已经成为所有教师共同的行为准则。教师主要源于北师大培养的最优秀毕业生，学校有最充足的师资后备力量，学校教学有非常强的再加工能力。学校注重师德建设和骨干教师、青年教师培养，“有追求，善学习，勤思考，勇实践，实践中能反思，遇问题会探究，学术上有专攻，教研上出成果”成为每位教师的追求。学校提倡骨干教师发挥带动和示范作用，激励青年教师迅速成长，形成了有力于教师和谐、健康成长的长效竞争机制，建立起了一支师德高尚、业务精湛的“学习型和研究型”教师队伍。学校德育建设重视学校教育、家庭教育和社会教育的统一，倡导德育的人文性，以对人的关爱和尊重为核心，不断探索德育自主性、层次性、整体性建设，效果显著。
在“构建学生的健全人格，打好学生的发展基础”的理念指导下，该校“尊重学生自主，倡导人文教育，重视环境熏陶，强调道德实践”，努力实现“三兼优一发展”(人格和身心发展兼优，知识基础和能力基础兼优，人文素养与科学素养兼优，个性得到健康发展)的目标。学校治校从严、务实，注重观念管理与情感交流。学校重视校风建设，在长期探索、实践中形成了“奉献、务实”的群体精神，“争创一流”的群体意识，“勤奋、廉洁、奉公”的干风，“团结、模范、求实”的党风，“正己、敬业、爱生”的教风和“勤奋、文明、朴素”的学风。
多年来，教育教学质量稳定在西城区较高水平。在德育上努力培养学生的责任意识、争优意识、吃苦意识、严格要求意识。坚持小、近、严、细、实、新、亲的原则。德育的特色是：赏识教育、惩戒教育、活动教育。注重学生的心理健康教育，首批获得了北京市“健康促进学校”金牌校的称号。良好的校风和学风受到好评。在教学上从“实”字入手，强化有效教学，从把好“六关”做起：把好备课关，备学生、备教材、备考纲、备教法，常备常新;把好上课关，严格要求，严密组织，积极调动，全员参与;把好作业关，全批全改，及时反馈，培养学生良好习惯;把好改错关，要求学生建立改错题本，查缺补漏，指导学生把书念薄;把好阶段复习检查关，学完一个章节，复习一个章节，检测一个章节，落实一个章节;把好辅导关，及时进行有针对性的集体或个体辅导，避免问题的积累。在抓好细节的基础上，扎实推进了教学质量的逐年提高。曾被评为首都文明单位、北京市德育先进校，北京市文明礼仪示范校、北京市百所好家长学校、北京市教育改革特色学校、全国和谐校园之星等荣誉称号。
“健康第一”是学校工作的指导思想，1999年、2000年分别通过了健康促进学校铜牌和银牌验收，2002年3月通过北京市健康促进学校验收。2000年被命名为中国青少年素质教育研究实践基地，2001年被命名联合国教科文组织EPD项目实验学校。2002年被命名为北京市心理教育实验学校。三十一中是北京市体育项目(排球)传统学校，西城区体育项目(游泳)传统校。在游泳、京昆、键盘乐、书法、绘画等方面也有出色表现。该校是北京市第一所推广软式排球的学校。学校排球代表队曾代表北京市参加全国中学生排球比赛。其中，排球、游泳等一直保持市、区比赛前三名。
